到了九月二十号，皇太极最宠爱的妃子宸妃海兰珠病重，于是皇太极安排好八旗的事情之后就匆忙返回了沈阳，皇太极在离开之前布防锦州，松山，杏山的，防守非常严密，其中总兵吴三桂趁夜劫营，无功而返。洪承畴，祖大寿的粮草非常充足他们的力量基本没怎么削弱，所以两军又相持了半年，互有胜负。
结果崇德七年，松山城的守将夏承德开城投降，也不知道这个明朝是怎么用人的，前有王朴后有夏承德，所以就这样蓟辽总督洪承畴，辽东巡抚邱明洋，总兵曹变蛟以及守将大小3000多人睡一宿觉就全都被俘虏了。洪承畴被押回了沈阳，其他官员以及誓死不降的军官全部被斩杀，松山一失守，杏山，塔山基本上就是一马平川没有屏障了，三个月后明朝总兵祖大寿在锦州投降，这是他第二次投降，这次是真的了，塔山三营又有7000人被杀。至此，松锦大战以清军大获全胜而告终。
但是回想一下真的是清军皇太极指挥的多么高明吗？我看不是，其实能看的出来早期的八旗军政体系还是有问题的，郑亲王济尔哈朗，裕亲王多铎，睿亲王多尔衮，包括皇太极本身都对洪承畴的13万大军有所忌惮，但是明朝的根已经烂透了，明末的时候武将大家都是军阀的思想，谁也不想削弱自已的实力，比如皮岛的毛文龙，和这个王朴，如果大明同仇敌忾我想清军应该没有实力来赢得这场战争，但是没办法腐朽无能的明朝这回真是气数已尽，已经不可能在组织起有效的反击了，到这边为止，皇太极完成了他老爹努尔哈赤没有完成的事情，辽东尽归大清所有，当年袁崇焕的关宁锦防线也不是不可逾越的障碍了，皇太极当时所掌握的国土面积差不多为500万平方公里，和明朝实际统治大致相等，这样就真的可以和大明掰掰手腕了。与他自已的目标打进山海关统一天下的目标又进了一步。