这三天时间里，小智除了关注自己精灵的特训成果以外，大部分的时间就待在科研区域，给4只暗黑神奇宝贝们上课，回答他们各种各样的问题，同时培养他们的世界观，还有三观。
俨然把四只暗黑神奇宝贝们当做了孩子一样对待。
甚至小智已经想好了，等四只暗黑神奇宝贝，能够离开培养仓以后，就把他们交给超梦他们去照顾，让超梦他们带着自己对应的暗黑神奇宝贝，去世界各地领略各种各样的风景。
而第3天的中午，小智和往常一样，在科研区域里给暗黑神奇宝贝们上课。
就在此时，小智接到了自己妈妈花子的电话，于是在暗黑神奇宝贝们睡着以后，返回了真新镇的家中。
而真新镇此时的家里，花子正坐在客厅当中的沙发上，正招待着客人。
这一客人小智认识，正是和他同村，同期一起去旅行的小萝莉，小黄！
“我回来了，妈妈！唉，小黄，你怎么在这？”小智进门刚打了声招呼，入眼便看到了坐在沙发上的小黄。
“你怎么这么晚才回来呀？我都给你打电话好一会儿了，小智，家里有客人等你，你也不知道快一点。”花子看到小智回来，直接起身开口抱怨道。
毕竟花子的电话都打过去两三个小时了，结果小智这时候才回来。
“哈哈哈……不好意思妈妈！主要是我有点事情，耽搁了。”小智对于花子的抱怨，傻笑着挠了挠头解释道。
“那你好歹说一声啊！小黄都在家里等半天了，我……”
“那个花子阿姨，没事的，是我突然拜访有些冒昧，而且我是有事请小智帮忙，所以等一会儿没什么的，再者我跟你聊天我很开心，并没有觉得等待有什么不妥的。”小黄见花子要继续抱怨，当即开口其小智解围。
“说的也是，我跟小黄你聊天也是很开心，有时候我感觉生闺女真的比生小子好多了，我家这臭小子，一天到晚的净给我惹事，害得我一天到晚净担心。”花子闻言点了点头，同时摸了摸小黄可爱的小脑袋，眼神当中尽是喜爱。
而小智对于花子的抱怨，并没有说什么，他可不敢在自己老妈面前造次。
“好了，我还有点事要离开一下，你们俩聊，相信你们俩应该能聊得来，毕竟都是同龄人。”花子说着起身朝着屋外走去，同时顺带还带走了家里的魔墙人偶，至此家里就只剩下了小黄以及她的皮卡丘皮皮，外加上小智。
“你好啊，小黄！听说你有事找我什么事啊？”小智看着自己的妈妈出门，随后跟小黄打了声招呼，便直接坐在了小黄对面的沙发上，询问对方今天来找他的目地。
对此小黄也没有藏着掖着说出了自己来此的目的：“是这样的小智，我听说你们智太集团有一种矿泉水，里面附带着强悍的生命力，只要喝一口就能消除人一天的疲惫，就是我对那个矿泉水挺好奇的，想研究一下，可以吗？”